Como organizar los archivos de un sitio web?

[freesoftwarrior]

no estoy seguro a que llamarás módulos pero yo siempre he usado esta estructura:

imagenes
-jpg
-gif
-png

media
-swf
-audio

setup
-css
-js



si cada módulo al que tu te refieres necesita una carpeta propia, yo mantendría la misma estructura mencionada en cada carpeta...