Hola GameRoot:
Aprovechando la recursión, hice esta función:
<html>
<head>
<script language=javascript>
function Cambio_Base(n, base) {
var _n = parseInt(n);
var _base = parseInt(base);
if (_n < _base) return n;
return Cambio_Base(parseInt(_n / _base), base) * 10 + (_n % _base);
}
</script>
<head>
<body>
<form name=cambioBase>
<input type=text name=n value="">
<input type=text name=base value="">
<input type=text name=resultado value="">
<input type=button value=chequear onclick="document.cambioBase.resultado.value = Cambio_Base(document.cambioBase.n.value, document.cambioBase.base.value)"
</form>
</body>
</html>
... Puse la página completa porque sirve de ejemplo
Saludos