Fácil y sencillo
Usa un cd de win98 o winME y luego booteas con el e inicias la pc con compatibilidad para cd rom, al en ms-dos te queda algo así y pones lo que te dire:
A:\>d: (en caso de que tu cd rom sea la unidad d)
D:\>cd win98(si el cd es de winME pones cd win9x)
D:\WIN98\>fdisk/mbr
Solo pones esta instrucción y nada más, la ejecutara y estara restaurado tu MBR o tu sector de arranque que es lo que se hecho al perder, tal vez por ahi moviste algo con el partition que le hizo algo al GRUB y por eso no te aparece el selector de S.O.
Bueno eso es todo, ojalá te haya ayudado