Hola Alberto, espero que estés bien:
Recuerdo que cuendo me puse a desarrollar una librería gráfica basada en capas, las capas vacías (completamente, en explorer quedaban como lineas verticales cuando el tamaño que había definido era de 1px x 1px, y es que al menos pone ese espacio de la altura de una letra (aunque no exista, y lo arregle con overflow: hidden;
Aunque en mi explorer 8 se ve bien... tal vez solo se trate de que le pongas un doctype
Saludos