Hola chapu:
No estoy seguro de como hacer lo que pides, pero conozco una alternativa y es poner en el href el script del onclick, y en la condición direccionar...
<a href="javascript
:pregunta(...)">...
y en el script:
function pregunta(...) {
if (confirm(...)) location.href="borra.php?..."
Espero que te sirva
Saludos
