Bueno .. "diagramas de navegación" no he visto yo (no quiere decir q no existan ..)
Pero si tuviera que hacerlo en "papel" como ha de funcionar el sitio segun parametros como "es usario registrado?" .. entonces ---> tal tal tal -> "es administrador?" --> "algun nivel de acceso?"
Esto yo lo haría con los tradicionales "diagramas de flujo":
Un ejemplo (por si no lo conoces ..y un software de diseño):
http://www.smartdraw.com/resources/e...flowchart5.htm
Por lo demas .. la idea la tienes bastante clara .. salvo como en todo proyecto suele pasar que hay q pulir algunas cosas.
Un saludo,