hola, podes crear una hoja de estilos específica para ie6 y llamarla (<link>) con
comentarios condicionales. Luego en esa hoja de estilos le das la distancia (top/right/left/bottom) que se adapte a tu necesidad.
Tene en cuenta que las distancias (desde el eje de coord. 0,0 esq. sup/izq) en una caja con posicion absoluta serán tomadas en base al primer ancestro relativo y si este no existe tomará como referencia al primer ancestro static, o sea <body>.
Espero te sirva, un saludo
