Sigue mostrandose la imagen segunda, me he asegurado del nuevo id y le he quitado el antiguo por si da conflicto pero se visualiza
Código PHP:
<!--[if IE 6]>
<img src="images/header_completo.jpg" width="860" height="353" />
<script type='text/javascript'>
document.getElementById('imagenOtros').style.display = 'none';
</script>
<![endif]-->
<img src="images/header_subtitulo.png" id="imagenOtros" />