tomare como si el archivo donde esta el codigo completo se llamara ficheros.php ok?.
bueno.. comenzemos xD
oviamente cuando habres el archivo ficheros.php ejecuta el codigo porque va haciendo todo de una, lo que tenemos que hacer aqui es poner una condicion que aga que solo se ejecute una vez aya echo click en <a href="ficheros.php?borrar='.$row['id'].'">Borrar</a>
bueno, entonces vamos a hacer esto:
en la condicion de abajo if ($borrar) { cambialo por: if ( ($borrar) && ($id) )
eso ara que si hay algun valor en id y en borrar entonces ejecuta accion
no se para que funciona esta funcion: htmlspecialchars() espero que no afecte el valor de el $_GET borrar
bueno, si algo envia un mensaje ;)