Seria algo asi mas o menos:
Código PHP:
<form action="" method="post" enctype="multipart/form-data">
<input type="file" name="archivos[]">
<input type="file" name="archivos[]">
<input type="submit" value="Enviar">
</form>
<?
//esto contiene los datos del primer archivo a subir
$tmp_name = $_FILES["archivos"]["tmp_name"][0];
$tamano = $_FILES["archivos"]["size"][0];
$tipo = $_FILES["archivos"]["type"][0];
//esto contiene los datos del segundo archivo a subir
$tmp_name = $_FILES["archivos"]["tmp_name"][1];
$tamano = $_FILES["archivos"]["size"][1];
$tipo = $_FILES["archivos"]["type"][1];
//podras ver, entonces, que estas serian variables
//...arrays que contienen info de los arhivos a subir
//y pueden ser recorridas con un loop (...for, por ejemplo)
$_FILES["archivos"]["tmp_name"];
$_FILES["archivos"]["size"];
$_FILES["archivos"]["type"];
?>