la forma en que lo haces no respeta relaciones, solo en tu imaginación cabe el cómo...
pero si analizas este ejemplo, ya te darás una idea
Código HTML:
<input type="text" name="id_docente[ID_DOCENTE]" />
<input type="text" name="examen[ID_DOCENTE][1]" />
<input type="text" name="examen[ID_DOCENTE][2]" />
<input type="text" name="examen[ID_DOCENTE][3]" />
como conseguirlo y como tratarlo con PHP, te lo dejo a tu imaginación... ;)