imprimir la deuda mayor de un cliente

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Si haces copy-paste del codigo, y cambias el nombre de las variables, deberia resultar lo mismo, que es lo que te ocurre.
Haz un cambio en la lógica para obtener cosas distintas.

Ademas, si lees 2 veces el archivo, lo tienes que cerrar para volver a leerlo. Mejor es: leer 1 vez un registro, usando fread() y luego usar logica para establecer el valor de tus variables.