Hola:
Lo poco descriptivo del título, convierte el mensaje en "poco interesante"... te propongo que edites el título y hagas una pregunta mejor...
Sobre la consulta; un popup reconoce a la página que lo abrión como el objeto "opener", o sea que puedes crear una lista con un código más o menso asÍ.
<select onchange="opener.recibir(this.value); window.close()"...>
Y programas en la página principal el método recibir para ubicarlo donde corresponda.
Saludos