Prueba esto:
Crea un archivo php, y tan solo ejecutalo:
Código PHP:
<?
$thisvar = "Valor de la variable \$thisvar que se vera el la popu";
if($thisvar != ""){
?>
<script type="text/javascript" language="javascript">
$v=window.open();
$v.document.write('<?=$thisvar?>')
</script>
<?
}
?>
</style>
Saludos..!