Un proyecto para varios clientes

[XDMerinoM]

Lo que debes haces es parametrizar simplemente. Exigir dentro de tu estandard que tengas una tabla con parametros de la aplicacion y que obvio exista en ambos servidores con los datos de una u otra empresa. Al iniciar tu aplicacion, como dijo Darkavender puedes jugar con las conexiones de base de datos dependiendo si es uno u otro cliente. Es mas, incluso tu podrias manejas ambos ambientes en una sola base de datos de prueba con los datos de tus dos clientes, simplemente jugando con parametrizacion y claro manejando un id como un codigo empresa por ejemplo.

Espero haberte ayudado.