Hola
si entendí bien, lo que quieres es crear un objeto de otra clase. En la clase Punto tienes get y set . 
Creo que en tu clase main debes crear dos objetos Punto(parece un cálculo para la pendiente ;) )  y mandarlos, así:  
Con este constructor:   
 Código PHP:
    class Linea
{
 
        private Punto pntoA;
        private Punto pntoB;
        public Linea(Punto a, Punto b)
        {
                this.pntoA = a;
                this.pntoB = b;
        }      
} 
    
  Y En tu clase main:   
 Código PHP:
    Punto x= new Punto(1,2);
Punto y= new Punto(5,6);
Linea li=new Linea(x,y); 
    
  Aunque concuerdo en algo con cosme1, no sé por qué usas más de un punto.  
Saludos