Puedes provar esto
En el HTML
Código ASP:
Ver original<asp:HyperLink ID="HyperLink1" runat="server" NavigateUrl="#" >HyperLink</asp:HyperLink>
En el code behind
Código ASP:
Ver originalHyperLink1.Attributes.Add("onClick", "window.open('http://www.asp.net','windownname','location=1,status=1,scrollbars=1,width=100px,height=100px, top=100px, left=100px')");