Suponemos que te refieres a JavaScript Y no a Java? ...
En tal caso .. si conoces que PHP se ejecuta en el servidor y que Javascript en el cliente .. tan solo tienes q incrustar tu código javascript en tu script PHP bien sea como "incrustado" o "lanzado" por PHP:
versión incrustado:
Código PHP:
<?
echo "esto es PHP .. ok?";
?>
<Script languaje="javascript">
<!-- instrucciones javascript -->
</script>
<?
// mas PHP ..
?>
Versión "lanzado via PHP (y usando sintax 'here doc')":
Código PHP:
<?
echo <<<HTML
<Script languaje="javascript">
<!-- instrucciones javascript -->
</script>
HTML;
echo "mas PHP";
?>
Un saludo,
pd: Xias .. repasa la teoría de PHP !!! si no lo conces nunca comprederas nada!