Como estructurar y documentar un website?

[Tantra]

-Hola amigos, la verdad es que el Título lo dice todo. Hay mucha información tecnica en estos foros, pero muy poca es relativa a la realización de una documentación consistente.
-Lo cierto es que el día 5 de Mayo tengo que entregar mi proyecto de fin de carrera y no se por donde empezar a documetar.
Además no me van a calificar por el diseño del site, o la buena estructuración del codigo, sino por la calidad de la documentación.
-Espero que alguno de ustedes pueda proporcionarme información sobre los puntos que debe tener la documentación de un website, o mejor aún la docuentación original de algún website que hayan realizado.

Gracias por su ayuda