Hola, tras muchos intentos, a mi me ha funcionado de la siguiente forma pero
sin editar nada en el archivo plantilla.rtf Código PHP:
$plantilla = str_replace("\\'f1","'f1",$plantilla); // Letra ñ
$plantilla = str_replace("\\'e1","'e1",$plantilla); // Letra á
$plantilla = str_replace("\\'e9","'e9",$plantilla); // Letra é
$plantilla = str_replace("\\'ed","'ed",$plantilla); // Letra í
$plantilla = str_replace("\\'f3","'f3",$plantilla); // Letra ó
$plantilla = str_replace("\\'fa","'fa",$plantilla); // Letra ú
$plantilla = str_replace("\\'80","'80",$plantilla); // Letra € Euro