Bueno, no se que sistema de base de datos usas, pero lo normal sería usar las tablas para introducir datos y hacer consultas para ver, actualizar, borrar etc.
Las consultas puedes enlazarlas como origen de datos igual que una tabla. Un ejemplo de consulta sería:
Código PHP:
SELECT expediente.num, vehiculos.matricula, personas.nombre
FROM ((expediente INNER JOIN expedientes ON expediente.id_expediente=expedientes.id_expediente) INNER JOIN vehiculos ON expedientes.id_vehiculo=vehiculos.id_vehiculo) INNER JOIN personas ON expedientes.id_persona=personas.id_persona
WHERE (((expediente.num)=1));
Devuelve numero expediente, matricula vehiculos, nombre personas del expediente numero 1.
Access por ejemplo permite vincular las tablas automaticamente por medio de formularios y subformularios.