Sí es posible restringir las páginas que indexan los buscadores. Debes colocar en el directorio principal de tu sitio un archivo robots.txt. Puedes encontrar el formato en Internet.
Por ejemplo, para inhabilitar los directorios proyecto1 y proyecto2 puedes escribir en tu archivo de robots lo siguiente:
Código HTML:
Ver originalUser-agent: *
Disallow: /proyecto1
Disallow: /proyecto2
Lo mejor creo que sería que implementaras una forma de identificación de los clientes para que sólo ellos pudieran ver el proyecto, proporcionándoles un usuario y una contraseña.
Saludos,