¿cual es la manera correcta de hacer un exec?

[Triby]

Si el proceso a ejecutar va a tardar mucho deberas modificar el tiempo limite de proceso de la pagina ejemplo: ini_set('max_execution_time', 500); cambiando 500 por la cantidad de segundos que deseas establecer tomo tiempo maximo de ejecucion.

Otra opcion es ejecutar el proceso en segundo plano usando /dev/null &
Ejemplo: exec("php /ruta/script.php> /dev/null &");