Prueba a meter el id del alumno en el nombre del checkbox
Código PHP:
echo "<br><input type=\"checkbox\" name=\"seleccion[".$row['id']."]\" value=\"".$row['id']."\">".$row['email']."<br>";
Otra cosa porque has comentado la linea...
Código PHP:
while ($row=mysql_fetch_array($sql)){
//mail($row['email'],$_POST[concepto],$cuerpo,$desde))
}
Si está comentada nunca enviará el email
Saludos!