Duda con formato de caracteres a la hora subir archivos

[juanolo]

Cuando subo un archivo con move_uploaded_file(); si el archivo tiene ñ por ejemplo, el archivo me lo sube al servidor (mi pc local) cambiando la ñ por ñ

Toda mi web y base de datos esta en UTF-8 y en la base de datos se guarda bien con la ñ pero en la carpeta del servidor me lo guarda como ñ.

A la hora de subir archivos al servidor (ya sea mi local o cuando lo suba realmente a un servidor linux)... las carpetas FTP no soportan UTF8 para guardar los archivos?

Lo digo porque lo he logrado solucionar poniendo utf8_decode($nombre_archivo) que supuestamente lo que hace es pasar de UTF8 a ISO el contenido de esa variable no? y asi, si guarda el nombre del archivo con la ñ

¿Tendre que poner utf8_decode($nombre_archivo) a todos los nombres de archivo que suba para que se suban bien?