UF ! Ahora descubrí que el problema era con las images gif!
 
Para que las gif funcionen hay que modificar la funcion _parsegif() en el archivo fpdf.php  
Por esto: 
 Cita:  function _parsegif($file)
{
	//Extract info from a GIF file (via PNG conversion)
	if(!function_exists('imagepng'))
		$this->Error('GD extension is required for GIF support');
	if(!function_exists('imagecreatefromgif'))
		$this->Error('GD has no GIF read support');
	$im=imagecreatefromgif($file);
	if(!$im)
		$this->Error('Missing or incorrect image file: '.$file);
	imageinterlace($im,0);
	$tmp=tempnam('.','gif');
	if(!$tmp)
		$this->Error('Unable to create a temporary file');
	if(!imagepng($im,$tmp))
		$this->Error('Error while saving to temporary file');
	imagedestroy($im);
	$info=$this->_parsepng($tmp);
	unlink($tmp);
	return $info;
}
    referencia: 
http://code.google.com/p/html2pdf/issues/detail?id=2 
Ahora el tema para resolver son las imagenes PNG con transparencia. Las comunes no dan problemas, pero las de transparencia tiran error:  
FPDF error: Alpha channel not supported