Hola oscareduardodelgado.
Lo primero que tienes que tener en cuenta es que la comunicación entre el lector de huellas y la apliación web se va a realizar a través del navegador, por tanto, necesitarás utilizar un ActiveX que el usuario pueda instalar en su navegador.
Aquí tienes un SDK que puede que te sirva para empezar (en inglés):
http://www.griaulebiometrics.com/pag...-guide/activex
Un saludo.