Con flash no, no podrás usar ese script. Necesitas darle ese efecto desde dentro del propio archivo flash.
Fijate que el script que pretendes usar es para una imagen, que usa un tag concreto <img src= etc
En cambio una movie de flash usa otro tag para ser insertado o incrustado en el html.
Si quieres aplicar ese efecto a un flash, habrás de hacerlo desde flash
