Hola,
gracias por tu ayuda, encontré la función jquery que me permite mantener la misma performance en todos los browsers, dado que luego de limpiar un div tengo que cargar nueva información en otro/s div/s, y esto generaba la archiconocida diferencia de interpretación por parte de distintos navegadores.
Código:
$("#div1,#div2").empty();
Saludos