Mira, tú mismo te respondiste en la línea anterior al de la consulta COUNT :
Código PHP:
Ver originalecho 'Tu ID es: ' , $miid2 [0] ;
$query = mysql_query("SELECT COUNT(*) AS cid FROM reffers WHERE user_id='".$miid2."'");
$miid2 devuelve un arreglo con los datos devueltos por la consulta, debes especificar el ID.
.