Hola Rod_Man_mx, lindo ambiente sharepoint. Mira, llevo bastante tiempo trabajando y desarrollando para MOSS y realmente te recomiendo que inicies apartir de una master page en blanco, de esta forma no dañaras la master page original.
Te digo que no hay tutoriales o al menos no hay uno completo hasta el momento. Lo que si te puedo recomendar es un aritculo de Microsoft sobre la master page basica.
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa660698.aspx
Que debes hacer? Crea una masterpage nueva y pega el codigo de la Minimal Master Page (ten en cuenta que hace falta un <asp:content place holder> que debes adicionar, mira bien todo la guia), construye una tabla en la mp y comienza a distribuir los elementos a tu gusto y por supuesto a agregar nuevos, realiza una copia de la pagina Default.aspx y luego coloca la nueva masterpage como predefinida.
Tambien puedes utilizar javascript y jquery para crear funciones mas agradables.
En estos momentos estoy trabajando en pequeño video tutorial sobre "branding de moss" que prontro estare publicando y espero que ayude a muchos con este tema. (Ojo no estoy tratando de hacer propaganda ni mucho menos spam)
Luego de esto solo es dejar la imaginaciób y claro armarse de mucha paciencia.
Saludos,