Hola !
Te recomiendo que utilices Net Beans 6.8 ya que creo yo que seria mejor para los novatos , ya cuando tengas un poco mas de experiencia utiliza Eclipse .Ambos son gratuitos !
Net Beans :
Eclipse :
Aqui te dejo el link de un libro .pdf donde te explica cual es la logica de java , sintaxis, etc :
Cita: http://books.google.com.pe/books?id=uIVJiAPlBq0C&printsec=frontcover&dq=java& cd=8#v=onepage&q&f=false
Espero haberte Ayudado ! =P