No, no necesitas agregar un textarea ya que el comando convierte el elemento que quieras en un editor. La realidad es que no es necesario que sean textarea para que que sean editores.
El focus no te funciona porque el div ya no existe cuando lo cambias al editor. Puedes usar mceFocus de tinyMCE.execCommand.
Código Javascript
:
Ver originaltinyMCE.execCommand('mceFocusl', false, id);
Por eso te deje esta página para que veas lo que hay disponible:
http://wiki.moxiecode.com/index.php/TinyMCE:Commands
No sé como cambiar el theme, pero debe haber una forma.