No, el problema ya me ha tocado personalmente, y he visto a otros usuarios, y la solución(es) la(s) puede(s) ver acá :
http://blog.pumka.net/2009/12/24/seo...elative-links/
La solución que elegí, fue la siguiente :
Agregar la siguiente línea en tu html principal :
Dónde los .css, .jss e imágenes deben encontrarse dentro de 'principal'. La razón exacta de porqué al trabajar con url's amigables ocurre esto, no la recuerdo, pero esa solución me sirvió.
Voy a buscar otro mensaje en el que ayudé hace un tiempo, a un usuario que tuvo el mismo problema, mientras prueba lo que te pasé.
Nos vemos.
EDIT : Encontré el tema. Acá el usuario @lobo_php da la solución que utilizó :
http://www.forosdelweb.com/f18/htacc...wf-etc-773207/