Creo tablas como mysLsam pero algunas cambian a InnoDB

[gnzsoloyo]

En realidad el título no dice nada, a menos que te expliques con más detalle en qué contexto y con qué sentencia se produce tu problema.
Ten en cuenta estas cosas:
1) El motor por default de MySQL desde la versión 5.0.x es InnoDB y no MyISAM.
2) El motor Isam quedó obsoleto. Se debe suplantar por MyISAM.
3) La cláusula TYPE para definir el motor es obsoleta. Corresponde ENGINE.
4) Si no tienes habilitado el motor MyISAM, no lo usará. Igual con el InnoDB.
5) Finalmente, y principal: Si no indicas correcta y específicamente como MyISAM, y estás usando MySQL 5.0.x, se crearán como InnoDB.

Así que, como verás, a menos que detalles qué hiciste y en qué entorno y contexto, el título no nos dice nada.

Danos mejores detalles de lo que has hecho...

Saludos.