para que replace te lleve al ancla que desees, tienes que incluir el ancla en la url a reemplazar. es decir, si quieres ir al ancla
#actasaclara, en la url de replace tienes que incluirlo. es lo que entiendo que quieres hacer.
Código:
top.location.replace('index.html?criterios.htm~mai nFrame#actasaclara');