Con un software firewall tiene el asunto resuelto. También con un proxy o, incluso, puedes usar bloqueo desde el navegador (mozilla y plugins).
Con ISA server tienes suficiente para bloquear todo lo que quieres. Con Freeproxy tiene solo para filtro URL. Sobre como hacer lo que quieres en ISA Server... tienes gran cantidad de información en google. Por ejemplo buscando un poco tenemos:
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http://support.microsoft.com/kb/925120/es (bloqueo tráfico Messengger en ISa Server 2006)
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http://martinllamas.blogspot.com/200...sa-server.html
etc,