Hola,
A mi me gusta usar visio, sin embargo tienes una gama de productos, aqui los enlaces de unos cuantos.
http://projects.gnome.org/dia/ http://office.microsoft.com/es-es/visio/default.aspx http://staruml.sourceforge.net/en/
Staruml es muy poderoso y mas complicado de usar.
Dia es gratis y facil de usar
Visio es de microsoft, pero no es malo
Saludos,