Al preguntar "cual esta más demandado" J2SE o JEE esta por demás saber que debes empezar por lo más básico!
Te recomiendo ampliamente los cursos online que imparte el Profesor Raúl Oramas, el material que tiene en sus cursos son en verdad de muy alta calidad en contenido y en estética, además de utilizar herramientas propias para la capacitación, lo mejor de todo es que son completamente gratuitos!
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Saludos!!