Si quieres imprimir una tabla HTML debes tener código HTML, por lo que acá debería haber un error:
Código PHP:
$htmlTable='<TD>';
$pdf->EAN13(10,10,$codigo);
$htmlTable='</TD>';
$pdf->EAN13(10,10,$codigo); genera el código de barras en una posición específica del documento.
Si quieres armar el documento a partir de código HTML, $pdf->EAN13(10,10,$codigo) tendría que ser una imagen para poder hacer algo del estilo:
Código PHP:
$htmlTable = '<TD>';
$htmlTable = '<img src="images/' . $pdf->EAN13(null,null,$codigo) . '" alt=""/>';
$htmlTable = '</TD>';
y entonces volvemos al principio con lo que te propuso carxl.
La otra posibilidad es que armes el documento jugando un poco con las variables XY.
espero que te sirva, saludos