Saludos.
Yo he usado exitosamente para cambiar el tamaño de las particiones (o eliminarlas) en windows un programa muy bueno y gratuito que se
llama partition wizard, es fàcil de usar pero aún así lee con cuidado antes de hacer algún paso ya que aunque tiene un listado de acciones para deshacer en caso que te arrepientas lo recomendable es la prudencia para evitar errores que quitan tiempo.
Partition Wizard soporta los sistemas de archivos FAT, FAT32 y NTFS, eso sí, se recomienda ejecutar el desfragmentador de disco y respaldar los datos importantes antes de ejecutar partition wizard
bájalo de aquí y nos platicas cómo te fue.
http://partition-wizard.softonic.com/