Bueno, Kalvinman, lo mejor que puedes hacer es poner en Google algomo como "importar grandes bases de datos con phpmyadmin", y obtendrías cosas como:
Alternativas a phpMyAdmin: subir base de datos grandes
Esto tiene algunas buenas ideas, y sobre todo:
allow memory en phpmyadmin al importar una BD
O sea, hay muchas partes por donde puedes atacar.
Solamente debes tener paciencia buscando...