Hola Urjose
No es tan difícil.
Caso A
Una
empresa hará referencia a uno y sólo un
país , pero en un
país pueden haber varias
empresas
Entonces
Empresa:
IdEmpresa (clave primaria)
IdPais (references Pais)
Caso B
Una
empresa hará referencia a varios
países y en un
país pueden haber varias
empresas
Entonces
Empresas
IdEmpresa
Paises
IdPais
Empresa_Pais
IdEmpresa | IdPais
Espero que te haya quedado claro. De no ser así, no dudes en consultar y trataré de ser más claro
Suerte