O ya vi tu imagen... tanto si lo haces con AJAX o no... en el primer caso revisa que tu función sustituye todo el contenido.... digamos que tienes esto:
Código:
<div id="principal">
<div id="encabezado"></div>
<div id="contenido"></div>
<div id="pie"></div>
</div>
Me imagino que si lo haces con AJAX, tu función sólo sustituye el contenido del "div" con ID "contenido" ... y los demás quedan tal cual, por eso se ve que tu encabezado se "duplica" ¿¿no??... sería cosa de que tu función inserte todo el marcado en el "div" con ID "principal" o que tu función no inserte otro encabezado y traiga sólo el contenido insertandolo sólamente en el div "contenido"...
Si no lo haces con AJAX, con framesets... pues checa que igual no se te queda un "duplicado" por ahi...
Almenos, es lo que llegue a entender.