Hola que tal, tengo un problema que me parece muy raro, tengo una página a la que le integro codigo php, el cual funciona perfectamente, pero en el navegador IE me borra los javascripts o sea no se ven, si le quito el codigo php si se ven,

¿esto es algo común? alguien me dijo que era por la validacion de mi codigo, bueno valide el css y el html a 1.1 con puro html, pero es que la verdad no entiendo por que interfieren los codigos de php con por ejemplo los contadores de mi web y los anuncios. la verdad no se como arreglar eso y me gustaria que me dieran consejos ya que en google no encuentro ninguna referencia.
Gracias
ejemplos: ver en internet explorer
aqui no se ven tiene codigo php
http://manganimemas.com/animes/one-p...espanol-online
aqui si, "no tiene código"
http://manganimemas.com/validar.php