Hola NeBeRuS (y CORE):
Es posible que no funcione por no usar los tres parámetros del método open: página, ventana y atributos.
Prueba con:
<script>
var salgo=true;
function salir() {
if (salgo) {
open("/popups.php", "bye", "");
}
}
</script>
Saludos