claro a los eventos que asignas con jquery, el evento onclick en la etiqueta no tiene que ver con jquery
aca resetea el valor del input solo la primera vez y hace el alert en todos los click
Código HTML:
<html>
<head>
<title>Untitled</title>
<script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.js"></script>
<script type="text/javascript">
$(document).ready( function (){
$('input').bind ('click', function() {
$(this).val('');
$(this).unbind('click');
});
});
</script>
</head>
<body>
<input value="valor inicial" onclick="alert('mi alerta')">
</body>
</html>