Hola:
¿Y que tal llevas las validaciones del código? ¿Qué tal el posicionamiento en los buscadores? El CSS se hizo para "vestir" el HTML y las tablas para tabular datos. ¿Qué tu quieres hacer tus maquetaciones con tablas? ¡Adelante!. ¿Qué quieres hacer tus páginas con código no estandar? ¡Adelante!
Si echas un huevo en aceite caliente lo fríes si lo echas en agua lo cueces, tu comer comes un huevo pero... ¿es lo mismo?
Saludos.