Ayuda: ¿Como hago un sub programa?

[lordphoenixs]

Hola. no se como buscar esto en el foro, por eso lo pregunto de esta forma.
Tengo un proyecto que se llama principal y es donde tengo mi aplicaicon. Pero quiero hacer una sub aplicacion que corra independiente de la principal y que la pueda ejecutar ya sea llamandola desde el programa principal o de forma independiente (usando un JAR como ejecutable). No se si me he explicado bien, pero no se como hacer esto.