Hola,
Bueno pues nuca he podido trabajar con una maquina de estas (mi padre esta por comprar una pero aún no he podido comprobar algunas cosas) pero me imagino que son como algunas oras maquinas de corte de tela, en este caso se hace los moldes con un programa vectorial y con un software especial (algunas maquinas tienen manera de hacerlo directamente en la misma) como el de las bordadoras se manda a la máquina a trabajar, normalmente estos software aceptan formatos universales como EPS, CDR o AI. Lo que vi alguna vez es que hacían los moldes y los acomodaban con una versión de Autocad para este fin (la verdad es que no he encontrado nada sobre este programa).
Saludos